主世界是多种生物的家园。生物的习性各不相同，且可能会对玩家造成不同程度的威胁，而根据这些特征，生物可以被分成数个类别。不同种类的生物也拥有不同生成条件，其中包括时间、亮度、生物群系以及其他一些因素。在其他维度（譬如下界）中生成的生物偶尔会通过传送门进入主世界。然而，末影龙和凋灵这样的Boss生物无法使用传送门。
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悦灵（Allay）
是一种会飞行的友好生物，能够寻找附近的同种掉落物并投掷到玩家或音符盒旁。
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犰狳（qiú yú）
（Armadillo）是一种生成于热带草原和恶地的友好生物，在受到惊吓时会蜷缩成一团。
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美西螈（Axolotl）
是一种水生的友好生物，会攻击其他大多数水生生物。
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蝙蝠（Bat）
是一种会飞的友好生物，生成于黑暗的地下洞穴中，用于渲染气氛。
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蜜蜂（Bee）
是居住在蜂巢或蜂箱的友好生物，但会在被激怒后成群结队地反击。
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骆驼（Camel）
是一种生成于沙漠村庄的友好生物。
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猫（Cat）
是一种可驯服的友好生物。
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熊猫（Panda）
是一种生成在竹林的友好生物。
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鸡（Chicken）是一种常见友好生物。它们是鸡肉、羽毛和鸡蛋的来源。
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豹猫（Ocelot）
是一种丛林中罕见的友好生物。
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狐狸（Fox）
是一种通常生成在针叶林、原始针叶林和积雪针叶林生物群系的、夜行性的友好生物。
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驴（Donkey）
是一种被驯服后可以骑乘并驮货物的生物。
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羊驼（Llama）
是一种驯服后可以驮运货物的友好生物。 行商羊驼（Trader Llama）是羊驼的独特变种，一般伴随着流浪商人生成。
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马（Horse）
是一种可驯服生物，被驯服后可以骑乘。
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发光鱿鱼（Glow Squid）
是鱿鱼的变种，有着发光的纹理。
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鸡骑士（Chicken Jockey）
是幼年僵尸及其变种骑着鸡的罕见组合。
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僵尸（Zombie）
是一种常见的亡灵敌对生物，具有多个变种。
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海豚（Dolphin）
是一种生活在除冷水海洋和冻洋以外的海洋里的友好生物。
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苦力怕（Creeper）
是常见的敌对生物，会悄无声息地接近玩家，当距离目标3格以内时就会开始爆炸。苦力怕是火药的主要来源，也是获得大多数音乐唱片的唯一途径。 被闪电击中后，苦力怕会转化为闪电苦力怕（Charged
Creeper），具有更强大的爆炸威力，可以由此获得生物头颅。
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骡（Mule）
是一种被驯服后可以骑乘并驮货物的生物。
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沼骸（Bogged）
是生成于沼泽中的骷髅变种。
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山羊（Goat）
是一种生成于山地类生物群系的友好生物。
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铁傀儡（Iron Golem）
是一种高大且强壮的友好生物，用于保护玩家和村民。
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